Всероссийский образовательный проект «Наука в регионы» стартовал в феврале 2017 года по инициативе Фонда развития физтех-школ, Физтех-Союза, МФТИ и Физтех-Лицея. Основной целью проекта осталась построение национальной системы подготовки и развития талантливых школьников на основе «системы Физтеха» по приоритетным направлениям инновационного развития страны. В августе 2021 года лицей заключил договор на создание эксперементальных классов по этому проекту.